Problemet med hovedagenten beskriver utfordringer som oppstår når agenter og rektorer har motstridende interesser. Demokratisk valgte regjeringsformer er vanlige i mange førsteverdensland. Disse nasjonene blir ofte styrt som republikker eller direkte demokratier som opererer ved å la innbyggerne velge sine egne myndighetspersoner. Disse tjenestemennene er agenter for folket de representerer.
Folket, alle rektorer per definisjon etter å ha valgt sine representanter, antar at tjenestemennene tar beslutninger som kommer til beste for nasjonen. Perfekte agenter, som har perfekt informasjon om disse beste interesser og blir motivert for å tjene rektor, opptrer for rektor selv når rektorens interesser er i konflikt med sine egne. Offentlighetsmedlemmer antar ofte at deres representanter i regjeringen vil representere deres ideelle interesser med få problemer. Hver gang myndighetspersoner opptrer i sine egne private interesser, innfører de potensielt konflikt i forholdet til velgerne.
Denne utfordringen oppstår med individuell velgerrepresentasjon og også med virksomheter som samhandler med representanter fra myndighetene. Et problem for industrien, for eksempel, er den potensielle konflikten mellom næringsdrivende og innleide agenter som hjelper til med å navigere i regulering av industrien. Mange firmaer har avdelinger som har til oppgave å tolke og anvende regjeringens politikk. Mange av de ansatte som er ansatt for disse avdelingene har erfaring fra offentlig sektor og kan komme tilbake til myndighetsarbeid i fremtiden.
For disse ansatte er det lite insentiv for å holde regelverket enkelt og minimalt i offentlig tjeneste. Virksomhetens beste er i konflikt med interessene til sine egne myndigheter. I denne forstand mener noen at avdelinger for forretningsforbindelser opptrer mot bedrifts lønnsomhet ved å forfølge mål som gir liten fordel for konkurranseevnen og selskapets resultater. Eventuelle utfordringer ville være et resultat av at disse ansatte har et insentiv til å handle mot selskapet.
På samme måte kan representanter som er valgt for å jobbe i statlige organisasjoner ha en interesse av å opptre i strid med velgerens interesser.
I følge byråteorien krever det å tilpasse incentiver til å løse problemer med hovedagent. Hvis tjenestemenn kan dra fordel av økte sysselsettingsmuligheter hos private firmaer som et direkte resultat av økende regulering av industrien, blir ikke interessene til virksomheter ivaretatt på riktig måte. Offentlig valg av representasjon kan bare delvis ta opp dette problemet ved å la tjenestemenn fritt handle i egne interesser etter valg. Offentlige ansatte drar ofte fordel av regulering og skaper en potensiell betydelig interessekonflikt for industrien.
I privat sektor er problemer med hovedagenter også svært vanlige og må løses for å minimere skade på konkurranseevnen. Bedrifter som er bekymret for hovedagenteproblemet, kan nøye undersøke insentiver som oppmuntrer til aktiviteter som ikke genererer inntekter, og forklarer deres avdelinger hvordan myndighetsregulering kan påvirke fremtidig lønnsomhet for selskapet.
